افتُتحت المرحلة الثانية من مستشفى الآغا خان في دار السلام يوم السبت 9 مارس 2019 من قبل سعادة قاسم مجاليوا، رئيس وزراء جمهورية تنزانيا المتحدة، والأميرة الزهراء آغا خان.

بدأت المرحلة الثانية، عام 2012، وذلك كجزء من عملية تطوير للمستشفى، حين بدأت مؤسسة الآغا خان للخدمات الصحية بعملية توسيع بلغت قيمتها 192 مليار شلن تنزاني، الأمر الذي ساهم في زيادة قدرة استيعاب مستشفى الآغا خان من 74 سريراً إلى مستشفى تعليمي ثلاثي المستوى يضم 170 سريراً، فضلاً عن قيامه بتوفير التسهيلات لتقديم برامج سريرية متقدمة وناجحة في أمراض القلب، الأورام، علم الأعصاب، العناية المركّزة (بما في ذلك العناية المركّزة لحديثي الولادة)، وصحة الأم والطفل، وكل ذلك يتم دعمه من خلال تشخيصات الأخصائيين، إضافةً إلى غرف العمليات المتكاملة وقسم الإسعاف والطوارئ المتطور.