يعمل برنامج الآغا خان للعمارة الإسلامية (AKPIA)، الذي يتخذ مقره في جامعة هارفارد ومعهد ماساتشوستس للتكنولوجيا (MIT)، بتدريب المهندسين المعماريين والمخططين والمدرسين والباحثين المؤهلين، الذين يمكنهم تقديم مساهمات فعّالة لتلبية احتياجات مجالات البناء والتصميم في المجتمعات ذات الطابع الإسلامي.

يلعب أعضاء هيئة التدريس والطلاب والخريجين دورًا فعّالًا في تطوير وتقوية ممارسة العمارة الإسلامية من خلال برنامج الآغا خان للعمارة الإسلامية. يُعتبر هؤلاء المشاركون عناصر فاعلة في تحليل وتفسير العمارة الإسلامية كتخصص معماري مهم وكقوة ثقافية مؤثرة. منذ إنشائه في عام 1979، استفاد البرنامج من المِنح المقدمة من سمو الآغا خان. يهدف البرنامج إلى تقديم تعليم متميز في مجالات الفن والهندسة المعمارية، من أجل تعزيز الفهم الشامل للعمارة الإسلامية والتخطيط الحضري والثقافة البصرية، مع التركيز على التراث الثقافي الغني للعالم الإسلامي.

يهدف موقع "Archnet.org" لأن يصبح الأرشيف الأكثر شمولًا على الإنترنت للموارد الرقمية المتعلقة بالعمارة والتصميم الحضري والتنمية في العالم الإسلامي.

يضم الموقع مجموعات وموارد ووثائق من صندوق الآغا خان للثقافة (AKTC)، وبرنامج الآغا خان للعمارة الإسلامية في جامعة هارفارد ومعهد ماساتشوستس للتكنولوجيا، بالإضافة إلى مجموعات من المحفوظات والوثائق التاريخية التي تم التبرّع بها.

في عام 2009، وقع حاكم ولاية تكساس، ريك بيري، وسمو الآغا خان، اتفاقية تعاون تهدف إلى تعزيز وتوسيع التعاون في مجموعة متنوعة من المجالات. تشمل هذه المجالات التعليم، والعلوم الصحية، والتأهب لمواجهة الكوارث الطبيعية والتعافي منها، والثقافة والبيئة.

منذ توقيع هذه الاتفاقية، تم تنفيذ العديد من المبادرات المشتركة، وبخاصة مع جامعة الآغا خان (AKU). وقد تم تنفيذ هذه المبادرات في إطار برنامج التاريخ والثقافات الإسلامية في جامعة تكساس في أوستن. بالإضافة إلى ذلك، تم تبني تبادل أعضاء هيئة التدريس بين جامعة تكساس "إيه آند إم" وجامعة الآغا خان، مما أسهم في تعزيز التبادل المعرفي والتجارب بين الجامعتين.

في نوفمبر 2009، تم التوقيع على اتفاقية تعاون بين ولاية كاليفورنيا والإمامة الإسماعيلية، والتي تهدف إلى تعزيز التعاون في مجموعة متنوعة من المجالات. تتضمن هذه المجالات التعليم، والإشراف البيئي والإدارة، والعلوم الصحية، وإدارة مخاطر الزلازل، بالإضافة إلى تعزيز التفاهم بين الثقافات.

يستمر التعاون بين مكتب كاليفورنيا لخدمات الطوارئ والوكالات الشريكة في مجالات متعددة، مثل التدريب على إدارة الطوارئ والإصابات الجماعية وتطوير المناهج الدراسية. تركز مذكرة التفاهم الموقعة بين جامعة الآغا خان وجامعة كاليفورنيا في سان فرانسيسكو على تطوير نماذج الرعاية الصحية الأولية في مناطق شرق إفريقيا وآسيا، بهدف الحد من وفيات الأمهات والأطفال الحديثي الولادة. وتقوم مذكرة التفاهم الموقعة بين مؤسسة الآغا خان للخدمات الصحية (AKHS) وكلية ديفيد غيفين للطب في جامعة كاليفورنيا في لوس أنجلوس بتعزيز التعاون في مجالات البحث وتبادل المعرفة، إضافةً إلى تنظيم مؤتمرات مشتركة في الموضوعات ذات الاهتمام المشترك.

تم توقيع اتفاقية التعاون مع ولاية إلينوي في عام 2011. تنص الاتفاقية على التعاون بين ولاية إلينوي وشبكة الآغا خان للتنمية في مجالات التعليم، والإشراف والإدارة البيئية، والعلوم الصحية، وعلوم المكتبات والمعلومات، وتطوير البنية التحتية، والاستدامة الزراعية والثقافة.

منذ توقيع الاتفاقية، قامت مؤسسة الآغا خان للخدمات التعليمية ومدارس شيكاغو العامة بإجراء مناقشات حول دمج تخصصات العلوم والتكنولوجيا والهندسة والرياضيات. في مجال الرعاية الصحية، دخلت مؤسسة الآغا خان للخدمات الصحية ومستشفى "شيرلي ريان أبيليتي لاب" في تعاون رسمي. يُعتبر المستشفى رائدًا في مجال إعادة التأهيل في الولايات المتحدة، (حصل على المرتبة الأولى في تصنيف "مؤسسة يو إس نيوز آند وورلد ريبورت" لمدة 26 عاماً على التوالي). في إطار هذه الشراكة، قام مستشفى "شيرلي ريان" بتزويد مؤسسة الآغا خان للخدمات الصحية بإمكانية الوصول إلى وحدات "مجموعة التعليم العالمية" التابعة له، والتي تتوافق محتوياتها مع الأهداف التعليمية لموظفي إعادة التأهيل في مستشفى الآغا خان في مومباسا.