تُسهم المرافق الرياضية الاستثنائية والتربية البدنية في أكاديمية الآغا خان في مومباسا بإعداد الطلاب للاستعداد للحياة الحقيقية، وتشجيعهم على القيام بأدوار قيادية بثقة وبروح التعاون. تعتبر المرافق جزءاً مهماً في تقديم الدعم للجيل القادم من قادة إفريقيا.

وفي معرض كلمته خلال افتتاح أكاديمية الآغا خان في كيلينديني بمومباسا، كينيا، في 20 ديسمبر 2003، قال سمو الآغا خان: " تتطلع هذه المدرسة الجديدة نحو عالم أفضل، فهي موجودة لمساعدة الطلاب على تنمية شخصياتهم وأفكارهم، فضلاً عن تعزيز المرونة العقلية لديهم، ما يُمكِّنهم من تحقيق النجاح والازدهار، وهذا ما نطمح إليه".