Bien que la Bibliothèque Aga Khan de Londres soit relativement récente, l’idée de son développement a germé en 2008, lorsque l’Institut pour l’étude des civilisations musulmanes de l’Université Aga Khan (AKU-ISMC) et l’Institut d’études ismailies (IIS) ont déménagé dans le même bâtiment au centre de Londres. Les deux institutions ont continué leur collaboration avec deux bibliothèques indépendantes implantées sur le même site. Les quatre partenaires avaient cependant des stratégies, des collections et des équipes distinctes. En 2014, afin de mieux répondre aux besoins de la communauté de chercheurs, d‘étudiants et d’enseignants, les bibliothèques ont fusionné pour former ce qui était officieusement considéré comme la bibliothèque commune IIS-ISMC : une bibliothèque combinant deux collections inestimables pour faciliter la recherche en études islamiques et en cultures musulmanes.