Em 2001, ao receber o prestigioso Prémio Archon da sociedade internacional de honra de enfermagem Sigma Theta Tau International, Sua Alteza disse num discurso que “há muito tempo que considero o aperfeiçoamento da profissão de enfermagem absolutamente fundamental para a melhoria dos cuidados de saúde no mundo em desenvolvimento e no mundo islâmico. O caminho a seguir passava pela profissionalização, institucionalização e dignificação desta grande profissão." Os Prémios Archon são atribuídos bienalmente a indivíduos que, independentemente da sua profissão, façam da promoção da saúde um aspeto importante das suas vidas e cujos esforços tenham criado mudanças significativas e de amplo alcance.

Nesse mesmo ano, Sua Alteza o Aga Khan começou a inaugurar escolas de enfermagem na África Oriental sob a égide da Universidade Aga Khan (AKU). Estas escolas, desenhadas para “profissionalizar, institucionalizar e dignificar esta grande profissão”, viriam a formar os enfermeiros e parteiras essenciais necessários no Quénia, Tanzânia e Uganda.

A AKU foi fundada em 1983 no Paquistão por Sua Alteza o Aga Khan, e hoje possui polos universitários no Quénia, Tanzânia e Uganda, tendo já concedido mais de 3000 diplomas e títulos universitários em toda a região. A Universidade oferece bolsas de estudo a nove de cada dez dos seus estudantes na África Oriental. As suas unidades académicas na África Oriental incluem a Faculdade de Medicina, a Escola de Enfermagem e Obstetrícia, a Escola Superior de Média e Comunicações, o Instituto da África Oriental e Instituto para o Desenvolvimento Humano. O Hospital da Universidade Aga Khan, com 300 camas, localizado em Nairobi, é o principal hospital particular de ensino na África Oriental.