Le Prix est dirigé par un comité directeur présidé par Son Altesse l'Aga Khan. À chaque cycle, un nouveau comité est constitué afin d'établir les critères d'éligibilité pour les projets qui seront soumis, de mettre en place une orientation thématique en réponse aux priorités et aux enjeux émergents et de planifier les futurs cycles du Prix. Le comité directeur sélectionne et désigne le grand jury à chaque cycle et programme les conférences, les expositions, les publications et les séminaires internationaux du Prix. La dotation actuelle du Prix s'élève à un million de dollars et est remise à des projets sélectionnés par le grand jury indépendant. Depuis 1977, le Prix a effectué 15 cycles, et plus de 9 000 projets du monde entier ont été documentés et compilés. À ce jour, les grands jurys ont remis le Prix Aga Khan d’Architecture à 128 projets.

Le Réseau Aga Khan de développement

Le Prix Aga Khan d’Architecture fait partie du Trust Aga Khan pour la culture (AKTC), qui met en œuvre un large éventail d'activités en vue de préserver et de mettre en avant le patrimoine matériel et spirituel des sociétés musulmanes. En tant qu'agence culturelle du Réseau Aga Khan de développement (AKDN), l'AKTC tire parti du patrimoine culturel pour s'en servir comme un moyen de soutenir et de catalyser le développement.