Cada Academia possui um Centro de Desenvolvimento Profissional (CDP). Estes visam fortalecer a profissão de professor, proporcionando oportunidades substanciais de aprendizagem profissional a professores e administradores escolares da Academia e de outras Escolas Aga Khan, bem como de escolas locais públicas e outras escolas sem fins lucrativos.

Os CDP colaboram com professores, diretores escolares, instituições de ensino superior locais e internacionais e órgãos governamentais de educação para desenvolver programas de acordo com as necessidades nacionais. Colaboram igualmente com outras agências da AKDN, como a Universidade Aga Khan e a Fundação Aga Khan.

Os programas dos CDP desenvolvem as competências dos professores através do reforço do seu conhecimento em cada disciplina e das suas práticas na sala de aulas. Estas abrangem técnicas de aprendizagem interativa, métodos de ensino centrados no aluno e o desenvolvimento da liderança. Cada CDP organiza também um Programa de Preparação de Professores de 18 meses que desenvolve jovens licenciados locais para se tornarem professores do currículo da International Baccalaureate (IB), com muitos deles a juntarem-se à comunidade da Academia após o programa. As Academias são a única instituição de ensino secundário autorizada pela IB a oferecer esta certificação. Os programas proporcionam aos participantes uma experiência de aprendizagem em serviço, na qual a teoria e a prática se complementam.

Enquanto centros de excelência que implementam as melhores práticas na educação e no ensino, as Academias Aga Khan são recursos valiosos para os sistemas educativos nas suas regiões.