A AKDN tem parcerias com o governo da Malásia e outras organizações nas áreas da saúde, educação, arquitetura, desenvolvimento da primeira infância e desenvolvimento económico. A AKDN e a Malásia também estabeleceram uma parceria na conferência Ambiente Estimulador para o Afeganistão e no desenvolvimento das capacidades no seu sector da saúde.
Um destaque assinalável tem sido a revitalização urbana e a conservação do local património da UNESCO de George Town, em Penang.
O Fundo Aga Khan para a Cultura (AKTC) tem vindo a colaborar desde 2013 com instituições malaias para apoiar a conservação do património e a regeneração urbana do núcleo histórico de George Town, reconhecido pela UNESCO. Em colaboração com a Corporação para a Conservação e Desenvolvimento de George Town (GTCDC em inglês) e a Think City, o AKTC tem contribuído para o planeamento estratégico e para iniciativas de implementação que melhoram os espaços públicos e protegem os bens culturais.
A parceria, prorrogada até Dezembro de 2025, continua a ser um modelo ao nível da regeneração urbana focada no património, demonstrando como o investimento cultural promove o desenvolvimento económico e a coesão social.
Uma das principais conquistas foi a reabilitação do histórico quebra-mar e a ampliação do passeio público com 570 metros em George Town, que ficou concluída em 2022. O projeto recebeu vários prémios que reconhecem a sua execução de alta qualidade e o seu contributo para a valorização do espaço público.
Atualmente, as obras concentram-se no restauro e reutilização adaptativa do Forte Cornwallis do século XVIII e na reintegração do seu fosso, tendo sido iniciadas respetivamente em 2018 e 2023. O Fosso Sul foi aberto em 2024. A conclusão do histórico fosso leste está prevista para Julho de 2025. Existem outros planos em andamento para aumentar o fosso para a parte norte do Forte Cornwallis.
Estas iniciativas visam oferecer soluções de última geração para a reabilitação de espaços públicos ao ar livre e o restauro e reutilização adaptativa das estruturas históricas na área designada como Património Mundial.
O projeto de George Town é inteiramente financiado por fundos estatais e municipais e recebe contribuições em espécie por parte da Think City. O financiamento cobre a prestação de serviços técnicos e de consultoria por parte do AKTC.
Para além de George Town, o AKTC também tem oferecido conhecimentos técnicos e museológicos para a reabilitação e expansão do Museu Nacional (Muzium Negara) em Kuala Lumpur. O Plano de Gestão para a Conservação do Muzium Negara foi aprovado pelo Departamento do Património Nacional da Malásia em 2016.