La mission de l’UCA est de favoriser le développement socio-économique en Asie centrale, en particulier de ses communautés établies en montagne, en offrant un niveau d’enseignement supérieur internationalement reconnu, tout en aidant les peuples de la région à préserver leurs riches traditions culturelles et à s’en servir comme atouts pour leur avenir. L’UCA apporte avec elle l'engagement et le partenariat du Réseau Aga Khan de développement (AKDN).

L’UCA comprend l’École des arts et des sciences, l’École supérieure de développement, l’École de formation professionnelle et continue, l’Institut de politique publique et d’administration, l’Institut de recherche sur les communautés des régions de montagne, l’Unité pour le patrimoine culturel et les sciences humaines, le Programme de développement du corps enseignant en Asie centrale et le Programme Aga Khan de sciences humaines. Les programmes de licence de l’UCA sont proposés dans ses campus résidentiels à Naryn, en République kirghize, et à Khorog, au Tadjikistan. Le campus Tekeli, au Kazakhstan, devrait commencer à proposer des cours en 2021.